Das Süddeutsche Klimabüro nutzt die in verschiedenen Instituten des Karlsruher Instituts für Technologie vorhandenen Kompetenzen in der grundlegenden und angewandten Klimaforschung (KIT-Einrichtungen).
Darüber hinaus sind weitere Institute an verschiedenen Universitäten und wissenschaftliche Einrichtungen auf Bundes- und Landesebene im süddeutschen Raum assoziiert, die eine große Expertise auf unterschiedlichen Arbeitsfeldern zum Thema Klimawandel besitzen (assoziierte Einrichtungen).
Das Süddeutsche Klimabüro bildet mit drei weiteren regionalen Klimabüros der Helmholtz-Gemeinschaft ein deutschlandweites Netzwerk. Jedes Büro hat einen eigene regionale und thematische Schwerpunkte.